La structure de l’Observatoire s’appuie sur un comité de codirection ou comité exécutif, un comité de cogestion et un comité des partenaires. Les différents chantier et groupes de travail sont regroupés autour des principaux axes thématiques de recherche. l’OFDE est aussi associé au Réseau International Éducation et Diversité (RIED), cofondé par Maryse Potvin en 2013 (voir Le RIED).